@Jörg: nein keine Änderung, d.h. die .bash_historie wird bei ca. 27.000 Einträgen, egal was in den Bash-Konfigurationsdateien des Users steht, gekürzt.
@melmarker: Ich habe das Netz dazu schon mehrfach "abgegrast", da wird immer auf die beiden Variablen HISTSIZE und HISTFILESIZE verwiesen.
Die Problematik mit den mehrfachen offenen Konsolen ist mir bekannt. Dazu kann man aber die Variable PROMPT_COMMAND in der .bashrc mit history -a bestücken, also sowas:
PROMPT_COMMAND='history -a;echo -ne "\033]0;${USER}@${HOSTNAME%%.*}:${PWD/#$HOME/~}\007"'
Das bewirkt ein sofortiges schreiben in die Bash-Historie nach jedem ausgeführten Kommando. Irgendwas läuft trotzdem schief beim Kürzen den Historie.