Man sollte so was vor dem update lesen und nicht erst danach
Die Warnung sagt eingentlich nur aus, dass auf einigen Systemen die Neuanlage des symbolischen Links von lib64 -> lib schiefgeht. Danach geht gar nichts mehr. Kein Programm ist mehr zu öffnen, der Neustart endet in einer ganz gepflegten Kernelpanic.
Um diesen Zustand zu beheben: Von einem Verwaltungssystem oder CD in das System chrooten:
# in /
ln -s lib lib64
# in /usr
ln -s lib lib64
Mit dem DU weitermachen und freuen.
Neustarten und beten - eigentlich sollte jetzt alles wieder in Ordnung sein.
EDIT: Danke für den Hinweis, noch mal explizit /usr dazugenommen