mh,
punkt 1. towo hat es auf den Punkt gebracht, nicht siduction noch irgend ein Script welches vom siduction Team zur Verfügung gestellt wird hat jenes Unglück ausgelöst!
Und jetzt zum Problem.
Wenn Dateien automagisch geändert werden, so sind dies meist Konfigurationen eines Programms, bzw irgend welche cache Daten die zur Laufzeit eines Programms geändert werden.
Werden nun neue Daten in solch eine Datei durch ein laufendes Programm dort hinein geschrieben, so ändert sich der Inhalt jener.
Wird nun der Editor geschlossen mit dem man jene Datei bearbeitet hat, so wird man logischer weise darauf aufmerksam gemacht, dass sich jene Datei geändert hat und wie man weiter verfahren möchte und da fängt es dann an kritisch zu werden.
Was genau in deinem Fall passiert ist, wird man solange nicht nachvollziehen können, so lange wir nicht 100% Präzise wissen was Du versucht hast!?
Und Konfigurationen irgend welcher Programme sollte man nur dann ändern:
1. wenn man weiß was man tut
2. nur wenn jenes Programm/ jene Anwendung nicht läuft
2.1 auch nicht im Hintergrund, bzw. als deamon.
3 kein/e anderer/andere auf die Datei zugreift und zur gleichen Zeit jene bearbeitet ( dafür gäbe es z.B. git)
Ich habe jetzt mal ein wenig ins blaue geschossen, in der Hoffnung, das Ziel/Problem zumindest leicht angekratzt zu haben
Gruß
PS.: Bitte ändere die Überschrift, denn diese ist ein "Fake" und hat nichts, rein gar nichts mit Deinem Problem zu tun!