Hier könnten mehrere Sachen aufeinander treffen. Bei mir selbst sind Calibre, Audacity, Audacious, Kdenlive, FreeCAD und auch Wireshark friedlich nebeneinander installiert. Allerdings habe ich auch
http://deb-multimedia.org/ von Christian Marillat in meinen Quellen eingetragen. Das dürfte aber nur bei einem Teil der Pakete Auswirkungen haben.
Das Entfernen der Pakete libqt6*t64 ist normal. Das Namensanhängsel t64 war bei der t64-Transition erforderlich. Pakete, die diese ersetzen/aktualisieren kommen ohne t64-Anhängsel daher, um wieder beim klassischen Namensschema zu landen.
Ich würde dir ebenfalls dazu raten, zunächst mit dem Solver 3.0 zu schauen, ob sich da eine bessere Lösung anbietet. Meiner Erfahrung nach findet in solchen Situationen der neu Solver Lösungen zwischen upgrade und full-upgrade. Danach könnte man nach den verbliebenen Problemen/Abhängigkeiten schauen.
edlin