Die Datei ändert sich nicht wenn ein anderer Prozess drauf zugreift, sprich sie bleibt bei 0 Byte und ihren Rechten. Darüber ist keine Aussage zu treffen. Wenn allerdings ein anderer Prozess zugreift, sieht man das mit lsof, was aber bei dir nicht der Fall ist.
Hast Du das System mal rebootet und dann noch mal probiert? Du versuchst aber nicht das d-u auf der live-cd zu machen, oder?