Von der Warte aus, dass es neu ist, lass es so lange weg, bis jemand offiziell den Startschuss für die gefahrlose Nutzung des /run-Verzeichnisses gibt. Ich drücke das jetzt mal bewusst vorsichtig aus: Der alte Zustand funktioniert ja, und daran wird sich auch in der nächsten Zeit (2-10 Jahre) nichts ändern. Schöner ist es aber in neu, wenn es denn geht, auch wegen der Vorteile, die das Verzeichnis bieten wird - frühere Einbindung, zentraler Punkt für den Kram etc. Nur dass jemand ein Verzeichnis kreiert hat, heisst noch lange nicht, dass man es nutzen muss. (vgl. dazu xorg.conf und xorg.conf.d etc.)
Edit: Die weiteren Entwicklungen kann man hier finden:
grave bugs of udev (166-1 -> 167-1+gc2) <unfixed>
#621036 - udev should not assume that /run works just because it exists