Manchmal ist es wie verhext, Probleme die auf seltene Konstellationen beruhen, ...
Verdacht, irgendwo eine Datei nicht korrekt installiert wurde / gelesen werden kann (eventuell Rechte Problem).
debsums zeigt auch einige Fehler an, wenn ausschließlich mit DPKG gearbeitet wird.
OT !
Mal Logs (Kernel) in Auge behalte, die Meldung etwas genauer studieren und vergleichen.
Musste Anfang des Jahres das System zurücksetzen, nachdem (sporadische) Probleme mit Ram auftraten, die das (Datei)System langsam aber sicher in Mitleidenschaft gezogen haben, nicht das die Fehler wirklich aufgefallen sind, laut Checks war immer alles I.O. ! nur der Kernel direkt hat was gefunden.
Auch wenn es sehr weit hergeholt ist und nicht wirklich passt.
Mal in Hinterkopf behalten, wenn doch noch etwas hinzukommt, nicht immer gleich auf SID SW schieben.