Hallo,
das habe ich durch Ausprobieren heraus gefunden. Vor einigen Tagen hatte ich unter Debian Sid die gleiche Situation wie Du.
Da ich diese Datei mal selber vor längerer Zeit mit einem Editor bearbeitet habe, und sie da .gtkrc-2.0 geheißen hat, bin ich neugierig geworden, ob ein Umbenennen klappt.
Ich vermute, der gtk-engine und kde-gtk-config Kram kann sogar wieder deinstalliert werden, wenn diese Datei vorhanden ist und auch korrekte Pfade zu den installierten Themen aufweist.
Viele Grüße,
Holger