Also, /home/h/.local/share/akonadi/db_misc ist leer...
Ich verstehe leider Deine letzte Äußerung nicht ganz.
/home/h/.local/share/akonadi/socket-Sid/akonadiserver.socket gibt es übrigens (auch wenn socket-Sid nur eine Verknüpfung ist). Folglich müsste doch Dein Vorschlag "mysql_upgrade --socket=/home/h/.local/share/akonadi/socket-Sid/akonadiserver.socket" funktionieren...
h@Sid:~$ mysql_upgrade --socket=/home/h/.local/share/akonadi/socket-Sid/akonadiserver.socket
Looking for 'mysql' as: mysql
Looking for 'mysqlcheck' as: mysqlcheck
Running 'mysqlcheck' with connection arguments: '--port=3306' '--socket=/var/run/mysqld/mysqld.sock' '--socket=/home/h/.local/share/akonadi/socket-Sid/akonadiserver.socket'
mysqlcheck: Got error: 2013: Lost connection to MySQL server at 'reading initial communication packet', system error: 0 when trying to connect
FATAL ERROR: Upgrade failed
Übrigens, beide Dateien in /home/h/.local/share/akonadi/socket-Sid
also akonadiserver.socket sowie mysql.socket haben 0 bytes...
Vlt. klappt deswegen das upgrade nicht?