der_bud and 1 Guest are viewing this topic.
apt-get dist-upgradePaketlisten werden gelesen...Abhängigkeitsbaum wird aufgebaut....Statusinformationen werden eingelesen....Probieren Sie »apt --fix-broken install«, um dies zu korrigieren.Die folgenden Pakete haben unerfüllte Abhängigkeiten: libopenmpi-dev : Hängt ab von: libopenmpi3 (= 3.1.3-9) aber 3.1.3-5 ist installiert Hängt ab von: openmpi-common (>= 3.1.3-9) aber 3.1.3-5 ist installiert openmpi-bin : Hängt ab von: openmpi-common (>= 3.1.3-9) aber 3.1.3-5 ist installiert
apt --fix-broken installPaketlisten werden gelesen...Abhängigkeitsbaum wird aufgebaut....Statusinformationen werden eingelesen....Abhängigkeiten werden korrigiert ... FertigDie folgenden Pakete wurden automatisch installiert und werden nicht mehr benötigt: libglew2.0 libhttp-parser2.8 libhunspell-1.6-0 libicu-le-hb0 libicu60 liblouis16 liblvm2app2.2 liblvm2cmd2.02 libntfs-3g88 libopencv-core3.2 libopencv-imgproc3.2 liborcus-0.13-0 libplacebo6 libtbb2 libwayland-egl1-mesa node-pseudomap xfce4-mount-pluginVerwenden Sie »apt autoremove«, um sie zu entfernen.Die folgenden zusätzlichen Pakete werden installiert: libopenmpi3 openmpi-commonDie folgenden Pakete werden aktualisiert (Upgrade): libopenmpi3 openmpi-common2 aktualisiert, 0 neu installiert, 0 zu entfernen und 180 nicht aktualisiert.651 nicht vollständig installiert oder entfernt.Es müssen noch 0 B von 2.338 kB an Archiven heruntergeladen werden.Nach dieser Operation werden 16,4 kB Plattenplatz freigegeben.Möchten Sie fortfahren? [J/n]
apt-get install openmpi-common=3.1.3-9 libopenmpi3=3.1.3-9
apt-get install -y openmpi-common=3.1.3-9 libopenmpi3=3.1.3-9Paketlisten werden gelesen...Abhängigkeitsbaum wird aufgebaut....Statusinformationen werden eingelesen....Die folgenden Pakete wurden automatisch installiert und werden nicht mehr benötigt: libglew2.0 libhttp-parser2.8 libhunspell-1.6-0 libicu-le-hb0 libicu60 liblouis16 liblvm2app2.2 liblvm2cmd2.02 libntfs-3g88 libopencv-core3.2 libopencv-imgproc3.2 liborcus-0.13-0 libplacebo6 libtbb2 libwayland-egl1-mesa node-pseudomap xfce4-mount-pluginVerwenden Sie »apt autoremove«, um sie zu entfernen.Die folgenden Pakete werden aktualisiert (Upgrade): libopenmpi3 openmpi-common2 aktualisiert, 0 neu installiert, 0 zu entfernen und 239 nicht aktualisiert.651 nicht vollständig installiert oder entfernt.Es müssen 2.338 kB an Archiven heruntergeladen werden.Nach dieser Operation werden 16,4 kB Plattenplatz freigegeben.Holen:1 http://ftp2.de.debian.org/debian unstable/main amd64 libopenmpi3 amd64 3.1.3-9 [2.174 kB]Holen:2 http://ftp2.de.debian.org/debian unstable/main amd64 openmpi-common all 3.1.3-9 [165 kB]apt-listchanges: Changelogs werden gelesen...Es wurden 2.338 kB in 9 s geholt (256 kB/s).(Lese Datenbank ... (Lese Datenbank ... 5%(Lese Datenbank ... 10%(Lese Datenbank ... 15%(Lese Datenbank ... 20%(Lese Datenbank ... 25%(Lese Datenbank ... 30%(Lese Datenbank ... 35%(Lese Datenbank ... 40%(Lese Datenbank ... 45%(Lese Datenbank ... 50%(Lese Datenbank ... 55%(Lese Datenbank ... 60%(Lese Datenbank ... 65%(Lese Datenbank ... 70%(Lese Datenbank ... 75%(Lese Datenbank ... 80%(Lese Datenbank ... 85%(Lese Datenbank ... 90%(Lese Datenbank ... 95%(Lese Datenbank ... 100%(Lese Datenbank ... 385166 Dateien und Verzeichnisse sind derzeit installiert.)Vorbereitung zum Entpacken von .../libopenmpi3_3.1.3-9_amd64.deb ...Entpacken von libopenmpi3:amd64 (3.1.3-9) über (3.1.3-5) ...rm: das Entfernen von '/usr/lib/x86_64-linux-gnu/fortran/gfortran-8#' ist nicht möglich: Datei oder Verzeichnis nicht gefundenrm: das Entfernen von 'End' ist nicht möglich: Datei oder Verzeichnis nicht gefundenrm: das Entfernen von 'automatically' ist nicht möglich: Datei oder Verzeichnis nicht gefundenrm: das Entfernen von 'added' ist nicht möglich: Datei oder Verzeichnis nicht gefundenrm: das Entfernen von 'section' ist nicht möglich: Datei oder Verzeichnis nicht gefundendpkg: Warnung: »altes libopenmpi3:amd64-Skript des Paketes post-removal«-Unterprozess gab den Fehlerwert 1 zurückdpkg: stattdessen wird Skript aus dem neuen Paket probiert ...dpkg: Fehler beim Bearbeiten des Archivs /var/cache/apt/archives/libopenmpi3_3.1.3-9_amd64.deb (--unpack): Es gibt kein Skript in der neuen Version des Paketes - AbbruchVorbereitung zum Entpacken von .../openmpi-common_3.1.3-9_all.deb ...Entpacken von openmpi-common (3.1.3-9) über (3.1.3-5) ...rm: das Entfernen von '/usr/lib/x86_64-linux-gnu/fortran/gfortran-8#' ist nicht möglich: Datei oder Verzeichnis nicht gefundenrm: das Entfernen von 'End' ist nicht möglich: Datei oder Verzeichnis nicht gefundenrm: das Entfernen von 'automatically' ist nicht möglich: Datei oder Verzeichnis nicht gefundenrm: das Entfernen von 'added' ist nicht möglich: Datei oder Verzeichnis nicht gefundenrm: das Entfernen von 'section' ist nicht möglich: Datei oder Verzeichnis nicht gefundendpkg: Warnung: »altes openmpi-common-Skript des Paketes post-removal«-Unterprozess gab den Fehlerwert 1 zurückdpkg: stattdessen wird Skript aus dem neuen Paket probiert ...dpkg: Fehler beim Bearbeiten des Archivs /var/cache/apt/archives/openmpi-common_3.1.3-9_all.deb (--unpack): Es gibt kein Skript in der neuen Version des Paketes - AbbruchFehler traten auf beim Bearbeiten von: /var/cache/apt/archives/libopenmpi3_3.1.3-9_amd64.deb /var/cache/apt/archives/openmpi-common_3.1.3-9_all.deb
apt-get install libopenmpi3=3.1.3-9 openmpi-common=3.1.3-9
apt-get --reinstall install libopenmpi3=3.1.3-9 openmpi-common=3.1.3-9
apt policy
libopenmpi3: Installiert: 3.1.3-5 Installationskandidat: 3.1.3-9 Versionstabelle: 3.1.3-9 500 500 http://ftp2.de.debian.org/debian unstable/main amd64 Packages *** 3.1.3-5 100 100 /var/lib/dpkg/status
openmpi-common: Installiert: 3.1.3-5 Installationskandidat: 3.1.3-9 Versionstabelle: 3.1.3-9 500 500 http://ftp2.de.debian.org/debian unstable/main amd64 Packages *** 3.1.3-5 100 100 /var/lib/dpkg/status
openmpi-bin: Installiert: 3.1.3-9 Installationskandidat: 3.1.3-9 Versionstabelle: *** 3.1.3-9 500 500 http://ftp2.de.debian.org/debian unstable/main amd64 Packages 100 /var/lib/dpkg/status
libopenmpi-dev: Installiert: 3.1.3-9 Installationskandidat: 3.1.3-9 Versionstabelle: *** 3.1.3-9 500 500 http://ftp2.de.debian.org/debian unstable/main amd64 Packages 100 /var/lib/dpkg/status
651 nicht vollständig installiert oder entfernt.
apt policyPaketdateien: 100 /var/lib/dpkg/status release a=now 500 http://ftp.uni-stuttgart.de/siduction/fixes unstable/contrib amd64 Packages release o=Siduction,a=unstable,n=unstable,c=contrib,b=amd64 origin ftp.uni-stuttgart.de 500 http://ftp.uni-stuttgart.de/siduction/fixes unstable/main amd64 Packages release o=Siduction,a=unstable,n=unstable,c=main,b=amd64 origin ftp.uni-stuttgart.de 500 http://ftp.uni-stuttgart.de/siduction/extra unstable/main amd64 Packages release o=Siduction,n=unstable,c=main,b=amd64 origin ftp.uni-stuttgart.de 500 http://ftp2.de.debian.org/debian unstable/non-free amd64 Packages release o=Debian,a=unstable,n=sid,l=Debian,c=non-free,b=amd64 origin ftp2.de.debian.org 500 http://ftp2.de.debian.org/debian unstable/contrib amd64 Packages release o=Debian,a=unstable,n=sid,l=Debian,c=contrib,b=amd64 origin ftp2.de.debian.org 500 http://ftp2.de.debian.org/debian unstable/main amd64 Packages release o=Debian,a=unstable,n=sid,l=Debian,c=main,b=amd64 origin ftp2.de.debian.orgMit Pinning verwaltete Pakete:
dpkg --configure -a
apt-get --fix-broken install -yPaketlisten werden gelesen...Abhängigkeitsbaum wird aufgebaut....Statusinformationen werden eingelesen....Abhängigkeiten werden korrigiert ... FertigDie folgenden Pakete wurden automatisch installiert und werden nicht mehr benötigt: libglew2.0 libhttp-parser2.8 libhunspell-1.6-0 libicu-le-hb0 libicu60 liblouis16 liblvm2app2.2 liblvm2cmd2.02 libntfs-3g88 libopencv-core3.2 libopencv-imgproc3.2 liborcus-0.13-0 libplacebo6 libtbb2 libwayland-egl1-mesa linux-headers-4.19.6-towo.1-siduction-amd64 linux-image-4.19.6-towo.1-siduction-amd64 node-pseudomap xfce4-mount-pluginVerwenden Sie »apt autoremove«, um sie zu entfernen.Die folgenden zusätzlichen Pakete werden installiert: libopenmpi3 openmpi-commonDie folgenden Pakete werden aktualisiert (Upgrade): libopenmpi3 openmpi-common2 aktualisiert, 0 neu installiert, 0 zu entfernen und 239 nicht aktualisiert.2 nicht vollständig installiert oder entfernt.Es müssen 2.338 kB an Archiven heruntergeladen werden.Nach dieser Operation werden 16,4 kB Plattenplatz freigegeben.Holen:1 http://ftp2.de.debian.org/debian unstable/main amd64 libopenmpi3 amd64 3.1.3-9 [2.174 kB]Holen:2 http://ftp2.de.debian.org/debian unstable/main amd64 openmpi-common all 3.1.3-9 [165 kB]apt-listchanges: Changelogs werden gelesen...Es wurden 2.338 kB in 6 s geholt (409 kB/s).(Lese Datenbank ... (Lese Datenbank ... 5%(Lese Datenbank ... 10%(Lese Datenbank ... 15%(Lese Datenbank ... 20%(Lese Datenbank ... 25%(Lese Datenbank ... 30%(Lese Datenbank ... 35%(Lese Datenbank ... 40%(Lese Datenbank ... 45%(Lese Datenbank ... 50%(Lese Datenbank ... 55%(Lese Datenbank ... 60%(Lese Datenbank ... 65%(Lese Datenbank ... 70%(Lese Datenbank ... 75%(Lese Datenbank ... 80%(Lese Datenbank ... 85%(Lese Datenbank ... 90%(Lese Datenbank ... 95%(Lese Datenbank ... 100%(Lese Datenbank ... 385166 Dateien und Verzeichnisse sind derzeit installiert.)Vorbereitung zum Entpacken von .../libopenmpi3_3.1.3-9_amd64.deb ...Entpacken von libopenmpi3:amd64 (3.1.3-9) über (3.1.3-5) ...rm: das Entfernen von '/usr/lib/x86_64-linux-gnu/fortran/gfortran-8#' ist nicht möglich: Datei oder Verzeichnis nicht gefundenrm: das Entfernen von 'End' ist nicht möglich: Datei oder Verzeichnis nicht gefundenrm: das Entfernen von 'automatically' ist nicht möglich: Datei oder Verzeichnis nicht gefundenrm: das Entfernen von 'added' ist nicht möglich: Datei oder Verzeichnis nicht gefundenrm: das Entfernen von 'section' ist nicht möglich: Datei oder Verzeichnis nicht gefundendpkg: Warnung: »altes libopenmpi3:amd64-Skript des Paketes post-removal«-Unterprozess gab den Fehlerwert 1 zurückdpkg: stattdessen wird Skript aus dem neuen Paket probiert ...dpkg: Fehler beim Bearbeiten des Archivs /var/cache/apt/archives/libopenmpi3_3.1.3-9_amd64.deb (--unpack): Es gibt kein Skript in der neuen Version des Paketes - AbbruchVorbereitung zum Entpacken von .../openmpi-common_3.1.3-9_all.deb ...Entpacken von openmpi-common (3.1.3-9) über (3.1.3-5) ...rm: das Entfernen von '/usr/lib/x86_64-linux-gnu/fortran/gfortran-8#' ist nicht möglich: Datei oder Verzeichnis nicht gefundenrm: das Entfernen von 'End' ist nicht möglich: Datei oder Verzeichnis nicht gefundenrm: das Entfernen von 'automatically' ist nicht möglich: Datei oder Verzeichnis nicht gefundenrm: das Entfernen von 'added' ist nicht möglich: Datei oder Verzeichnis nicht gefundenrm: das Entfernen von 'section' ist nicht möglich: Datei oder Verzeichnis nicht gefundendpkg: Warnung: »altes openmpi-common-Skript des Paketes post-removal«-Unterprozess gab den Fehlerwert 1 zurückdpkg: stattdessen wird Skript aus dem neuen Paket probiert ...dpkg: Fehler beim Bearbeiten des Archivs /var/cache/apt/archives/openmpi-common_3.1.3-9_all.deb (--unpack): Es gibt kein Skript in der neuen Version des Paketes - AbbruchFehler traten auf beim Bearbeiten von: /var/cache/apt/archives/libopenmpi3_3.1.3-9_amd64.deb /var/cache/apt/archives/openmpi-common_3.1.3-9_all.deb
apt-get autoremove
Paketlisten werden gelesen... FertigAbhängigkeitsbaum wird aufgebaut. Statusinformationen werden eingelesen.... FertigProbieren Sie »apt --fix-broken install«, um dies zu korrigieren.Die folgenden Pakete haben unerfüllte Abhängigkeiten: libopenmpi-dev : Hängt ab von: libopenmpi3 (= 3.1.3-9) aber 3.1.3-5 ist installiert Hängt ab von: openmpi-common (>= 3.1.3-9) aber 3.1.3-5 ist installiert openmpi-bin : Hängt ab von: openmpi-common (>= 3.1.3-9) aber 3.1.3-5 ist installiertE: Unerfüllte Abhängigkeiten. Versuchen Sie »apt --fix-broken install« ohne Angabe eines Pakets (oder geben Sie eine Lösung an).
Die entsprechend angemeckerten Scripte in /var/lib/dpkg/info editieren, da ein exit 0 nach set -e reinmalen, abspeichen und apt -f installoder den Mist erstmal komplett purgen.
~towo:Defiant> apt policy openmpi-binopenmpi-bin: Installiert: (keine) Installationskandidat: 3.1.3-9 Versionstabelle: 3.1.3-9 500 500 http://deb.debian.org/debian unstable/main amd64 Packages 500 http://deb.debian.org/debian testing/main amd64 Packages
root@siductionbox:/home/ralph# apt full-upgradeReading package lists... DoneBuilding dependency tree Reading state information... DoneYou might want to run 'apt --fix-broken install' to correct these.The following packages have unmet dependencies: libopenmpi-dev : Depends: libopenmpi3 (= 3.1.3-9) but 3.1.3-5 is installed Depends: openmpi-common (>= 3.1.3-9) but 3.1.3-5 is installed openmpi-bin : Depends: openmpi-common (>= 3.1.3-7) but 3.1.3-5 is installedE: Unmet dependencies. Try 'apt --fix-broken install' with no packages (or specify a solution).[code]of course "apt --fix-broken install" fails with[code]Reading database ... 384097 files and directories currently installed.)Preparing to unpack .../libopenmpi3_3.1.3-9_amd64.deb ...Unpacking libopenmpi3:amd64 (3.1.3-9) over (3.1.3-5) ...rm: cannot remove '/usr/lib/x86_64-linux-gnu/fortran/gfortran-8#': No such file or directoryrm: cannot remove 'End': No such file or directoryrm: cannot remove 'automatically': No such file or directoryrm: cannot remove 'added': No such file or directoryrm: cannot remove 'section': No such file or directorydpkg: warning: old libopenmpi3:amd64 package post-removal script subprocess returned error exit status 1dpkg: trying script from the new package instead ...dpkg: error processing archive /var/cache/apt/archives/libopenmpi3_3.1.3-9_amd64.deb (--unpack): there is no script in the new version of the package - giving upPreparing to unpack .../openmpi-common_3.1.3-9_all.deb ...Unpacking openmpi-common (3.1.3-9) over (3.1.3-5) ...rm: cannot remove '/usr/lib/x86_64-linux-gnu/fortran/gfortran-8#': No such file or directoryrm: cannot remove 'End': No such file or directoryrm: cannot remove 'automatically': No such file or directoryrm: cannot remove 'added': No such file or directoryrm: cannot remove 'section': No such file or directorydpkg: warning: old openmpi-common package post-removal script subprocess returned error exit status 1dpkg: trying script from the new package instead ...dpkg: error processing archive /var/cache/apt/archives/openmpi-common_3.1.3-9_all.deb (--unpack): there is no script in the new version of the package - giving upErrors were encountered while processing: /var/cache/apt/archives/libopenmpi3_3.1.3-9_amd64.deb /var/cache/apt/archives/openmpi-common_3.1.3-9_all.debE: Sub-process /usr/bin/dpkg returned an error code (1)
rm: cannot remove '/usr/lib/x86_64-linux-gnu/fortran/gfortran-8#': No such file or directoryrm: cannot remove 'End': No such file or directoryrm: cannot remove 'automatically': No such file or directoryrm: cannot remove 'added': No such file or directoryrm: cannot remove 'section': No such file or directorydpkg: warning: old openmpi-common package post-removal script subprocess returned error exit status 1dpkg: trying script from the new package instead ...dpkg: error processing archive /var/cache/apt/archives/openmpi-common_3.1.3-9_all.deb (--unpack): there is no script in the new version of the package - giving upErrors were encountered while processing: /var/cache/apt/archives/libopenmpi3_3.1.3-9_amd64.deb /var/cache/apt/archives/openmpi-common_3.1.3-9_all.debE: Sub-process /usr/bin/dpkg returned an error code (1)
11:53:00 AM-Fri Jan 18-[piper@x1] $ suPassword: root@x1:/home/piper# apt install openmpi-bin Reading package lists... DoneBuilding dependency tree Reading state information... DoneThe following additional packages will be installed: libcaf-openmpi-3 libcoarrays-openmpi-dev libfabric1 libhwloc-dev libhwloc-plugins libhwloc5 libibverbs-dev libnl-3-dev libnl-route-3-dev libnuma-dev libopenmpi-dev libopenmpi3 libpmix2 libpsm-infinipath1 libpsm2-2 librdmacm1 openmpi-commonSuggested packages: libhwloc-contrib-plugins openmpi-docThe following NEW packages will be installed: libcaf-openmpi-3 libcoarrays-openmpi-dev libfabric1 libhwloc-dev libhwloc-plugins libhwloc5 libibverbs-dev libnl-3-dev libnl-route-3-dev libnuma-dev libopenmpi-dev libopenmpi3 libpmix2 libpsm-infinipath1 libpsm2-2 librdmacm1 openmpi-bin openmpi-common0 upgraded, 18 newly installed, 0 to remove and 113 not upgraded.1 not fully installed or removed.Need to get 5,862 kB of archives.After this operation, 23.6 MB of additional disk space will be used.Do you want to continue? [Y/n] yGet:1 http://10.10.10.3:3142/mirror.math.princeton.edu/pub/debian unstable/main amd64 libpsm-infinipath1 amd64 3.3+20.604758e7-6 [168 kB]Get:2 http://10.10.10.3:3142/mirror.math.princeton.edu/pub/debian unstable/main amd64 libpsm2-2 amd64 11.2.68-4 [177 kB]Get:3 http://10.10.10.3:3142/mirror.math.princeton.edu/pub/debian unstable/main amd64 librdmacm1 amd64 21.0-1 [65.0 kB]Get:4 http://10.10.10.3:3142/mirror.math.princeton.edu/pub/debian unstable/main amd64 libfabric1 amd64 1.6.2-2 [396 kB]Get:5 http://10.10.10.3:3142/mirror.math.princeton.edu/pub/debian unstable/main amd64 libhwloc5 amd64 1.11.12-1 [111 kB]Get:6 http://10.10.10.3:3142/mirror.math.princeton.edu/pub/debian unstable/main amd64 libhwloc-plugins amd64 1.11.12-1 [17.3 kB]Get:7 http://10.10.10.3:3142/mirror.math.princeton.edu/pub/debian unstable/main amd64 libpmix2 amd64 3.1.0~rc4-1 [497 kB]Get:8 http://10.10.10.3:3142/mirror.math.princeton.edu/pub/debian unstable/main amd64 libopenmpi3 amd64 3.1.3-9 [2,174 kB]Get:9 http://10.10.10.3:3142/mirror.math.princeton.edu/pub/debian unstable/main amd64 libcaf-openmpi-3 amd64 2.4.0-2 [35.6 kB]Get:10 http://10.10.10.3:3142/mirror.math.princeton.edu/pub/debian unstable/main amd64 openmpi-common all 3.1.3-9 [165 kB]Get:11 http://10.10.10.3:3142/mirror.math.princeton.edu/pub/debian unstable/main amd64 openmpi-bin amd64 3.1.3-9 [200 kB]Get:12 http://10.10.10.3:3142/mirror.math.princeton.edu/pub/debian unstable/main amd64 libcoarrays-openmpi-dev amd64 2.4.0-2 [35.2 kB]Get:13 http://10.10.10.3:3142/mirror.math.princeton.edu/pub/debian unstable/main amd64 libnuma-dev amd64 2.0.12-1 [39.2 kB]Get:14 http://10.10.10.3:3142/mirror.math.princeton.edu/pub/debian unstable/main amd64 libhwloc-dev amd64 1.11.12-1 [175 kB]Get:15 http://10.10.10.3:3142/mirror.math.princeton.edu/pub/debian unstable/main amd64 libnl-3-dev amd64 3.4.0-1 [102 kB]Get:16 http://10.10.10.3:3142/mirror.math.princeton.edu/pub/debian unstable/main amd64 libnl-route-3-dev amd64 3.4.0-1 [177 kB]Get:17 http://10.10.10.3:3142/mirror.math.princeton.edu/pub/debian unstable/main amd64 libibverbs-dev amd64 21.0-1 [355 kB]Get:18 http://10.10.10.3:3142/mirror.math.princeton.edu/pub/debian unstable/main amd64 libopenmpi-dev amd64 3.1.3-9 [974 kB]Fetched 5,862 kB in 1s (5,007 kB/s) Selecting previously unselected package libpsm-infinipath1.(Reading database ... 240845 files and directories currently installed.)Preparing to unpack .../00-libpsm-infinipath1_3.3+20.604758e7-6_amd64.deb ...Unpacking libpsm-infinipath1 (3.3+20.604758e7-6) ...Selecting previously unselected package libpsm2-2.Preparing to unpack .../01-libpsm2-2_11.2.68-4_amd64.deb ...Unpacking libpsm2-2 (11.2.68-4) ...Selecting previously unselected package librdmacm1:amd64.Preparing to unpack .../02-librdmacm1_21.0-1_amd64.deb ...Unpacking librdmacm1:amd64 (21.0-1) ...Selecting previously unselected package libfabric1.Preparing to unpack .../03-libfabric1_1.6.2-2_amd64.deb ...Unpacking libfabric1 (1.6.2-2) ...Selecting previously unselected package libhwloc5:amd64.Preparing to unpack .../04-libhwloc5_1.11.12-1_amd64.deb ...Unpacking libhwloc5:amd64 (1.11.12-1) ...Selecting previously unselected package libhwloc-plugins:amd64.Preparing to unpack .../05-libhwloc-plugins_1.11.12-1_amd64.deb ...Unpacking libhwloc-plugins:amd64 (1.11.12-1) ...Selecting previously unselected package libpmix2:amd64.Preparing to unpack .../06-libpmix2_3.1.0~rc4-1_amd64.deb ...Unpacking libpmix2:amd64 (3.1.0~rc4-1) ...Selecting previously unselected package libopenmpi3:amd64.Preparing to unpack .../07-libopenmpi3_3.1.3-9_amd64.deb ...Unpacking libopenmpi3:amd64 (3.1.3-9) ...Selecting previously unselected package libcaf-openmpi-3:amd64.Preparing to unpack .../08-libcaf-openmpi-3_2.4.0-2_amd64.deb ...Unpacking libcaf-openmpi-3:amd64 (2.4.0-2) ...Selecting previously unselected package openmpi-common.Preparing to unpack .../09-openmpi-common_3.1.3-9_all.deb ...Unpacking openmpi-common (3.1.3-9) ...Selecting previously unselected package openmpi-bin.Preparing to unpack .../10-openmpi-bin_3.1.3-9_amd64.deb ...Unpacking openmpi-bin (3.1.3-9) ...Selecting previously unselected package libcoarrays-openmpi-dev:amd64.Preparing to unpack .../11-libcoarrays-openmpi-dev_2.4.0-2_amd64.deb ...Unpacking libcoarrays-openmpi-dev:amd64 (2.4.0-2) ...Selecting previously unselected package libnuma-dev:amd64.Preparing to unpack .../12-libnuma-dev_2.0.12-1_amd64.deb ...Unpacking libnuma-dev:amd64 (2.0.12-1) ...Selecting previously unselected package libhwloc-dev:amd64.Preparing to unpack .../13-libhwloc-dev_1.11.12-1_amd64.deb ...Unpacking libhwloc-dev:amd64 (1.11.12-1) ...Selecting previously unselected package libnl-3-dev:amd64.Preparing to unpack .../14-libnl-3-dev_3.4.0-1_amd64.deb ...Unpacking libnl-3-dev:amd64 (3.4.0-1) ...Selecting previously unselected package libnl-route-3-dev:amd64.Preparing to unpack .../15-libnl-route-3-dev_3.4.0-1_amd64.deb ...Unpacking libnl-route-3-dev:amd64 (3.4.0-1) ...Selecting previously unselected package libibverbs-dev:amd64.Preparing to unpack .../16-libibverbs-dev_21.0-1_amd64.deb ...Unpacking libibverbs-dev:amd64 (21.0-1) ...Selecting previously unselected package libopenmpi-dev:amd64.Preparing to unpack .../17-libopenmpi-dev_3.1.3-9_amd64.deb ...Unpacking libopenmpi-dev:amd64 (3.1.3-9) ...Setting up libpsm2-2 (11.2.68-4) ...Setting up libnl-3-dev:amd64 (3.4.0-1) ...Setting up libnl-route-3-dev:amd64 (3.4.0-1) ...Setting up librdmacm1:amd64 (21.0-1) ...Setting up libhwloc5:amd64 (1.11.12-1) ...Processing triggers for siduction-dynamic-dms (2016.01.31) ...Setting up libpsm-infinipath1 (3.3+20.604758e7-6) ...update-alternatives: using /usr/lib/libpsm1/libpsm_infinipath.so.1.16 to provide /usr/lib/x86_64-linux-gnu/libpsm_infinipath.so.1 (libpsm_infinipath.so.1) in auto modeSetting up libhwloc-plugins:amd64 (1.11.12-1) ...Setting up openmpi-common (3.1.3-9) ...Processing triggers for libc-bin (2.28-5) ...Processing triggers for man-db (2.8.5-1) ...Setting up libnuma-dev:amd64 (2.0.12-1) ...Setting up libibverbs-dev:amd64 (21.0-1) ...Setting up libfabric1 (1.6.2-2) ...Setting up libhwloc-dev:amd64 (1.11.12-1) ...Setting up libpmix2:amd64 (3.1.0~rc4-1) ...Setting up libopenmpi3:amd64 (3.1.3-9) ...Setting up openmpi-bin (3.1.3-9) ...update-alternatives: using /usr/bin/mpirun.openmpi to provide /usr/bin/mpirun (mpirun) in auto modeupdate-alternatives: using /usr/bin/mpicc.openmpi to provide /usr/bin/mpicc (mpi) in auto modeSetting up libcaf-openmpi-3:amd64 (2.4.0-2) ...Setting up libopenmpi-dev:amd64 (3.1.3-9) ...update-alternatives: using /usr/lib/x86_64-linux-gnu/openmpi/include to provide /usr/include/x86_64-linux-gnu/mpi (mpi-x86_64-linux-gnu) in auto modeSetting up libcoarrays-openmpi-dev:amd64 (2.4.0-2) ...Processing triggers for libc-bin (2.28-5) ...
The following packages have unmet dependencies: libfabric1 : Depends: libpsm2-2 (>= 10.3-37) but it is not going to be installed libopenmpi-dev : Depends: libopenmpi3 (= 3.1.3-9) but 3.1.3-5 is to be installed Depends: openmpi-common (>= 3.1.3-9) but 3.1.3-5 is to be installed libopenmpi3 : Depends: libpsm2-2 (>= 10.3-37) but it is not going to be installed openmpi-bin : Depends: openmpi-common (>= 3.1.3-7) but 3.1.3-5 is to be installedE: Unmet dependencies. Try 'apt --fix-broken install' with no packages (or specify a solution).
Unpacking openmpi-common (3.1.3-9) over (3.1.3-5) ...rm: cannot remove '/usr/lib/x86_64-linux-gnu/fortran/gfortran-8#': No such file or directoryrm: cannot remove 'End': No such file or directoryrm: cannot remove 'automatically': No such file or directoryrm: cannot remove 'added': No such file or directoryrm: cannot remove 'section': No such file or directorydpkg: warning: old openmpi-common package post-removal script subprocess returned error exit status 1dpkg: trying script from the new package instead ...dpkg: error processing archive /var/cache/apt/archives/openmpi-common_3.1.3-9_all.deb (--unpack): there is no script in the new version of the package - giving up